Исследование кала на острые кишечные инфекции

Комплексное молекулярно-генетическое исследование кала на острые кишечные инфекции (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus) – лабораторный метод диагностики, определяющий генетическую информацию каждого вида микроорганизма, которые могут вызвать кишечную инфекцию.

Характеристики исследования:

Тип биоматериала: кал.
Синонимы (rus): ОКИ, ПЦР (кал)
Синонимы (eng): Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.
Метод исследования: Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Обычно анализ назначает инфекционист по показаниям, когда возникают признаки поражения ЖКТ на фоне инфицирования бактерией или вирусом. Диагностика осуществляется при помощи ПЦР анализа, который выявляет даже малейшие фрагменты ДНК микроорганизма.

Комплексное молекулярно-генетическое исследование кала на острые кишечные инфекции проводится для получения следующей информации:

наличие или отсутствие каждого микроорганизма в кишечнике;
дифференциальная диагностика бактериальной или вирусной инфекции с другими видами патологий ЖКТ или системными заболеваниями, если симптомы не специфичны;
подбор оптимальных лекарственных средств, которые влияют именно на выявленный микроорганизм;
оценка качества проведенного лечения, в данном случае тест назначают через несколько недель после завершения симптоматики (так можно не допустить рецидива патологии, если остатки микроорганизмов находятся в кишечнике).

После исследования врач-инфекционист сможет установить дифференциальный диагноз, затем сразу же начнет лечение, чтобы оно вызвало максимальный эффект.

Острая кишечная инфекция (ОКИ)

Острая кишечная инфекция развивается на фоне заражения разными видами патогенных микроорганизмов, каждый из них обладает своими особенностями.

Shigella spp. Это грамотрицательный микроорганизм, который обладает формой палочки. Он включен в семейство энтеробактерий. Данная бактерия не входит в состав условно-патогенной микрофлоры, при ее малейшем попадании в ЖКТ развивается шигеллез, провоцирующий дизентерию.
E. coli. Это микроорганизм в форме палочки, который по своим патогенным свойствам приближен к шигеллам. После распространения в кишечник вызывает воспаление и нарушение микрофлоры. В результате это приводит к сильной диарее с жидкой консистенцией, токсикозу, интоксикации, боли в животе по типу схваток.
Salmonella spp. Одна из разновидностей энтеробактерий, которые делятся на множество форм. После попадания в ЖКТ вызывает воспаление желудка и кишечника. Патология проявляется сильнейшей интоксикацией, диареей, обезвоживанием, болью.
Campylobacter spp. Это одна из самых распространенных бактерий, которые вызывают поражение желудка и кишечника в большей степени среди всех остальных микроорганизмов.
Adenovirus F. Это аденовирус разновидности F, который часто становится причиной гастроэнтерита. Кишечная инфекция может развиваться в любом возрасте, но чаще характерна для детей до 2 лет за счет сниженной функции иммунитета.
Rotavirus A. Инфекция, которая провоцирует острый воспалительный процесс во всех участках пищеварительной системы. На фоне инфекции развивается диарея, обезвоживание, дисбаланс кислотно-щелочного и электролитного равновесии.
Norovirus 2. Это одна из самых частых причин развития острой кишечной инфекции среди всех вирусов. Микроорганизм быстро распространяется по ЖКТ, причем воспаление образуется даже при минимальной концентрации микроорганизма. Вирус обладает повышенной устойчивостью к влиянию окружающих факторов, поэтому он быстро распространяется вне тела человека, вызывая заражение окружающих людей.
Astrovirus. Одна из причин кишечной инфекции, которая чаще поражает детей до 7 лет. Во время вирусного заболевания происходит поражение слизистой оболочки и эпителия кишечника, пейеровых бляшек. В результате образуется профузная диарея, которая сопровождается обезвоживанием.

Опасность ОКИ заключается в массе путей заражения. Перечисленные микроорганизмы могут распространяться через продукты питания, воду, немытые руки, окружающие предметы.

Показания для анализа

Молекулярно-генетическое исследование по выявлению основных бактерий и вирусов, провоцирующих ОКИ, проводится по следующим показаниям:

наличие негативной клинической симптоматики – сильная интоксикация, боль в нижней части живота, диарея различной консистенции и степени тяжести, повышение температуры тела свыше 38 градусов, в некоторых случаях рвота, повышенное газообразование в кишечнике;
наличие среди окружающих людей пациентов, у которых был подтвержден диагноз ОКИ;
распространение кишечной инфекции среди пациентов стационаров, при этом исследование назначают всем больным, мне зависимости от наличия или отсутствия симптомов;
профилактическое отслеживание сохранения или отсутствия инфекции после завершения терапии, чтобы предупредить рецидив, дальнейшее распространение микроорганизма среди людей.

Обычно показания определяет инфекционист или другой врач. Реже исследование проводят люди по собственной инициативе в профилактических целях. Например, если среди окружающих людей диагностирован один из патогенных микроорганизмов.

Как подготовиться к анализу

Перед сбором фекалий для анализа проходят последовательные этапы подготовки:

отмена лекарственных средств, которые могут привести к искажению результата исследования (например, антибиотики, противовирусные препараты, слабительные, красящие препараты на основе железа и других химических веществ);
соблюдение диеты накануне исследования, из продуктов питания исключают жирную, острую, жареную, копченую, чрезмерно соленую или сладкую пищу, пряности;
соблюдение водного баланса;
туалет наружных половых органов перед сбором биоматериала;
покупка стерильного одноразового контейнера, предназначенного именно для фекалий (применять посторонние емкости недопустимо).

Остальные факторы не влияют на результат, патогенные микроорганизмы будут выявлены даже в случае, если в кале содержится их минимальное количество.

Метод исследования

Первоначально из полученных фекалий изготавливают суспензию, которую применяют для проведения ПЦР методики. Ее выполняют по этапам.

Денатурация. Микроорганизм содержит в своей структуре ДНК. Для ее определения требуется разъединить цепи, чтобы получить отдельные нити генетического материала. В этих целях температуру суспензии повышают до 96°. Затем ее понижают до 60°, приступая к следующему этапу.
Связывание праймеров. Праймером является лабораторной реагент, который вводят в подготовленную суспензию. Он встраивается в структуру нити ДНК, идентифицируя ее начало и конец. Именно в этой области будет проводиться дальнейшее исследование.
Копирование генетической информации. Для этого повышают температуру образца до 72°, затем копируют элементы генетического материала многократное количество раз. Процедуру выполняют до тех пор, пока не будет получено достаточно материала, подлежащего исследованию. Все этапы повторяют многократно, обычно применяют 30 циклов.
Детекция. В этих целях применяют автоматическое оборудование. Оно идентифицирует полученный генетический материал, определяя точную разновидность патогенного микроорганизма.

Все этапы выполняют крайне быстро, поэтому результаты можно получить уже на следующий день после сбора биоматериала. Это значительно сокращает период от момента развития симптомов до начала терапии.

Расшифровка анализа

После проведения анализа аппарат выдает результаты. В норме каждый микроорганизм из комплекса молекулярно-генетического исследования присутствовать не должен, то есть значение отрицательное. Если выявлена малейшая концентрация бактерии или вируса, это показание к назначению терапии у инфекциониста. В зависимости от выявленных значений подбирают оптимальный препарат, который будет действовать на бактерию или вирус, вызывая ее уничтожение. Дополнительно используют симптоматическую терапию, чтобы устранить негативные признаки, которые провоцируют ухудшение самочувствия, влияя на состояние ЖКТ, водно-электролитный и кислотно-щелочной баланс.

Если исследование повторяют, остатки микроорганизмов свидетельствуют о сохранении инфекции и риске рецидива ОКИ. Отрицательный результат указывает на полное выздоровление.

Острые кишечные инфекции, ПЦР

Парсункова Кермен Анатольевна