Создан ПЦР-тест для выявления штаммов COVID-19

 Новый анализ выявит штаммы коронавируса SARS-CoV-2

Британские ученые разработали особую методику исследования, позволяющую выявлять не только инфицирование COVID-19, но и определять тип вирусного штамма. До сегодняшнего дня с этой целью использовалось полногеномное секвенирование нового поколения, считавшееся «золотым стандартом» определения вариантов вируса. Недостатками метода являются сложность проведения и высокая стоимость обследования. Созданный учеными ПЦР-тест может применяться для скринингового тестирования, при этом по чувствительности и специфичности он не уступает секвенированию. Метод аллель-специфической зондовой ПЦР представляет собой количественное определение вирусной РНК в образцах биоматериала, взятого из носоглотки. Тестирование позволяет обнаруживать наличие инфекции и ее вариант даже при незначительном количестве вирусных частиц или разрушенной РНК в образце.

Новая тест-система уже была опробована среди пациентов двух стран: Великобритании и Бразилии. Вирусные штаммы искали в более чем 700 образцах биоматериала из носоглотки, взятых у британских пациентов, и в более чем 350 образцах, взятых у бразильцев, заразившихся SARS-CoV-2. Были выявлены разные варианты мутаций вируса: в Британии D1118H, присущая альфа-варианту, в Бразилии два свойственных гамма-варианту изменения – K417T, L3468V. В ходе обследования пациентов с альфа-штаммом коронавируса показатель чувствительности составил 98 %, при этом специфичность достигла 100 %. Параметры для гамма-штамма также были на высоком уровне и составили 90–95 % и 91–100 %.

Новый тип исследования может применяться у пациентов на поздних стадиях коронавирусной инфекции. В этот период метод секвенирования не всегда позволяет выявить вариант инфекции из-за фрагментированности вирусной РНК. Еще одним преимуществом инновационной методики является возможность модификации теста для поиска новых штаммов, формирование которых возможно вследствие постоянных мутаций и изменений генома коронавируса. Созданный британскими учеными метод исследования окажет значительную помощь в отслеживании распространения вновь образованных вариантов SARS-CoV-2. Данные исследования были представлены на портале medRxiv.org.

Подпишитесь на рассылку новостей нашего сайта и Вы всегда будете в курсе всех событий и Акций медицинской лаборатории «ОПТИМУМ», а также самых последних новостей мировой медицины.

12.11.2021