Аденовирус (кал), ДНК Adenovirus spp, кач., ПЦР
Парсункова Кермен Анатольевна
ПЦР анализ кала на ДНК аденовирус
Определение ДНК аденовирусов (adenovirus) в образцах фекалий методом ПЦР – лабораторный метод диагностики, благодаря которому своевременно обнаруживают наличие или отсутствие аденовируса в кале, что требуется для назначения правильных методов терапии и предупреждения осложнений вследствие инфекции кишечника. Существует множество микроорганизмов, способных вызвать идентичную симптоматику кишечных расстройств и инфекций, поэтому важно провести дифференциальную диагностику.
Характеристики исследования:
- Тип биоматериала: фекалии
- Синонимы (rus): аденовирус, серотипы F40/F41, полимеразная цепная реакция в режиме реального времени
- Синонимы (рус): Group F adenovirus, AdV, Had V (real time polymerase chain reaction)
- Метод исследования: полимеразная цепная реакция в режиме реального времени, ПЦР
Для чего необходим анализ кала на аденовирус
При развитии кишечной инфекции у пациента появляются боли в нижней части живота, постоянная диарея, примесь слизи в кале. Так как подобную симптоматику вызывают разные бактерии и вирусы, требуется провести дифференциальную диагностику. Наиболее качественное и быстрое исследование в этом случае – полимеразная цепная реакция.
Тест необходим для достижения следующих целей:
- дифференциальная диагностика между различными вирусами и бактериями, чтобы определить наличие аденовируса;
- проверка качества назначаемых препаратов, при их эффективности объем микроорганизма в фекалиях значительно снижается или полностью устраняется;
- получение быстрой информации о виде возбудителя в короткие сроки, так как другие методы исследования требуют большего времени (результат от ПЦР приходит в течение суток, после посева – через неделю);
- выявление точного вида возбудителя даже в тех случаях, когда симптоматика размыта, наблюдаются лишь незначительные проявления кишечной инфекции.
Влиянию аденовируса подвержены люди разных возрастов, этот микроорганизм часто распространяется в респираторный тракт и кишечник, но не всегда вызывает инфицирование. Выполнять анализ рекомендуется только в тех случаях, когда наблюдается негативная клиническая симптоматика. Но делать это нужно только при появлении первых симптомов, если прошло 5-7 дней, обнаружить возбудитель затруднительно, так как он быстро исчезает из фекалий. В этом случае симптом воспалительных процессов остается даже после исчезновения инфекционного агента.
Назначение на анализ получают от терапевта, педиатра, инфекциониста, гастроэнтеролога. Этот же врач должен заниматься расшифровкой и последующим назначением лечения.
Общее описание ПЦР анализа ДНК аденовируса
Определение ДНК аденовируса в образцах фекалий методом ПЦР – одно из новых направлений в лабораторной диагностике, с точностью определяющее диагноз в короткие сроки.
Для теста характерны следующие особенности:
- врачу требуется лишь внести биоматериал в аппарат, оборудование само считывает требующиеся значения;
- действия лаборанта минимальные, поэтому риск врачебной ошибки исключается;
- приходят точные результаты, можно обнаружить не только аденовирус, но и его точную концентрацию в заданном объеме биоматериала;
- ПЦР оборудование выявляет микроорганизм даже в минимальном количестве образца биоматериала;
- проведение анализа осуществляется в режиме реального времени, то есть сразу после внесения биоматериала на мониторе оборудования появляется график, по которому врач-лаборант может предположить наличие или отсутствие инфекции;
- результаты исследования получают в течение суток, но при запросе экстренных данных их передают врачу уже через несколько часов;
- пациенту требуется пройти предварительную подготовку, чтобы анализатор смог выявить микроорганизм, а риск получения ошибочных сведений полностью устранился;
- биоматериал пациент собирает дома самостоятельно, но по строгим правилам;
- тест можно повторять многократно, так как для получения биоматериала не требуется проведения каких-либо инвазивных процедур (часто повторное исследование назначают после завершения лечения, чтобы подтвердить отсутствие инфекции, эффективность назначенных препаратов).
Полученные данные передают пациенту. Он должен обратиться с ними к лечащему врачу для расшифровки. Он соотнесет их с историей болезни, проявляющимися симптомами. При их учете диагноз будет достовернее, а назначенные препараты эффективны.
Когда назначают анализ
Для назначения ПЦР исследования с целью обнаружения аденовируса требуется наличие следующей клинической симптоматики:
- частая диарея, которая в разгар заболевания может наблюдаться после каждого употребления пищи;
- наличие посторонних элементов в фекалиях – слизь, кровь, гной;
- жидкий стул, отсутствие оформленных каловых масс;
- общие симптомы патологии ЖКТ – тошнота, рвота, потеря аппетита, боль в животе;
- повышение температуры тела, на первых этапах она может достигать до 39°, потом постепенно снижается до субфебрильных значений;
- общие симптомы недомогания – озноб, вялость, усталость, продолжительный сон.
Эти признаки встречаются при всех кишечных инфекциях. При аденовирусе дополнительно могут наблюдаться симптомы воспалительных процессов в респираторной системе. Например, ринит, боль в горле, кашель. Поэтому для подтверждения диагноза требуется провести ПЦР.
Подготовка к анализу
При назначении теста врач предупреждает о потребности предварительной подготовки по следующим этапам:
- отсутствие употребления антибиотиков, противовирусных, противогрибковых средств перед анализом при появлении первых симптомов патологии;
- отсутствие проведения клизмы для очищения кишечника за 1-2 дня;
- за сутки не употребляют жирную, острую, жареную, копченую, чрезмерно соленую еду;
- утром накануне исследования проводят туалет наружных половых органов;
- заранее покупают стерильный контейнер для фекалий, в комплекте должна идти специальная ложка, которой отбирают требующийся участок кала (запрещено использовать посторонние емкости, так как в них содержатся вещества и микроорганизмы из окружающей среды, которые испортят результат теста);
- собирают только свежие фекалии в утреннее время, которые отправляют в контейнере в лабораторию в ближайшее время (образец не должен простоять без исследования свыше 2 часов).
Чем быстрее выполнить перечисленные этапы, тем достовернее полученные сведения.
Методика проведения ПЦР анализа ДНК аденовируса
Сразу после доставки образца фекалий в лабораторию приступают к его обработке и анализу. Действия выполняют по этапам:
- смешивают реагенты для получения раствора, содержащего флюоресцентную метку, она должна войти во взаимосвязь со всеми частицами аденовируса, вызвав специфическое свечение, распознанное ПЦР оборудованием;
- добавление праймера к раствору, он нужен для идентификации начала и конца амплифицируемого участка;
- добавление в лунки лабораторного планшета трех различных компонентов – раствора с флюоресцентной меткой, праймера, образцов пациента (на их взаимодействие может уйти какое-то время, чтобы ускорить этот процесс, планшет можно ненадолго поставить в инкубатор, где температура слегка повышена);
- подключение и программирование ПЦР прибора, чтобы он смог распознать именно аденовирус, меченый флуоресцентным компонентом;
- добавление полученного раствора в прибор, запуск выбранной программы;
- просмотр созданных графиков на мониторе, где уже можно отследить наличие или отсутствие аденовируса в образце;
- распечатывание полученных сведений на лабораторном бланке, где содержатся данные пациента, найденное количество аденовируса, а также референсные значения для сравнения.
Важно помнить, что полученные сведения действительны лишь ограниченное время, так как аденовирус быстро перемещается и элиминируется из организма. Поэтому даже полученные отрицательные значения не гарантируют отсутствия заражения в ближайшее время.
Расшифровка анализа
В норме в ЖКТ, а точнее в кишечнике, не должно обнаруживаться любых следов аденовируса. Это посторонний патогенный микроорганизм, не входящий в условно-патогенную микрофлору. Поэтому единственным нормальным значением считается – «не обнаружено». Если выявлено любое количество аденовируса, требуется специфическое лечение кишечной инфекции.